Fue creado en 1995 con la finalidad de ocupar un lugar protagónico y relevante en temas referidos a las Ciencias Naturales en la provincia de Entre Ríos y optimizar las acciones de transferencia de tecnología en las distintas especialidades. Las grandes áreas del conocimiento donde se desarrolla investigación básica y aplicada son: Ciencias Biológicas, Ciencias de La Tierra, del Agua y de la Atmósfera y Área de Historia y Arqueología. El CICyTTP tiene como objetivos principales consolidar y desarrollar investigación científica en Actuopalinología, Arqueología, Biología Celular y Microbiología, Ecología de la Vegetación, Ecología Animal, Entomología, Estudio de la Biología de Insectos, Geología del Neógeno-Cuaternario, Herpetología, Ornitología y Conservación, Palinoestratigrafía, Paleobotánica y Paleontología de Vertebrados.