Mediante el estudio de los sitios y restos arqueológicos, en el Laboratorio de Arqueología se busca reconstruir los modos de vida y las dinámicas sociales de las poblaciones indígenas que ocuparon la región Litoral a lo largo del Holoceno.

Aborda aspectos relacionados con la funcionalidad y la cronología de los asentamientos; el entorno ambiental y las condiciones paleoclimáticas; el manejo de los recursos naturales; la dieta de estas poblaciones; y la variabilidad de los sistemas tecnológicos elaborados por los grupos indígenas que ocuparon el área en tiempos prehispánicos.